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根據食品研究所最新報告指出，腸道的狀況與腦部發展有正相關，透過益生菌的治療有助於改善腸胃道功能以及神經系統的障礙。研究顯示，包括自閉症和亞斯柏格症候群的患者，腸道菌相紊亂與失調，若讓自閉症和亞斯柏格症候群患者補充益生菌，有助腸道恢復正常。

食品研究所報告表示，泛自閉症（autism spectrum disorder, ASD）指的是廣泛性發展障礙下的自閉症、雷特症候群、兒童期崩解症、亞斯伯格症候群、及未分類廣泛性發展障礙，但是大多數的專家和家長在使用這個名詞時，是指自閉症、亞斯伯格症候群、及未分類廣泛性發展障礙。學界診斷ASD的標準工具有數種，其中常用的一種是自閉症診斷會談問卷（Autism Diagnostic Interview-Revised, ADI-R），透過對家長晤談的評分來判斷受測對象是否為ASD患者。

研究人員發現ASD兒童常伴隨腸胃道功能障礙，腸道菌相紊亂失調，且其功能障礙的程度以及腸道中Desulfovibrio spp.(脫硫菌株)的數量與患者的ADI指數有高度的正相關，若讓ASD兒童補充益生菌，有助於腸道菌相恢復正常。此外Hsiao 等人在2013年也發現，腸道菌株會對宿主的代謝產生影響，且腸道狀態與腦部有著關聯性，透過益生菌治療有助於改善腸胃道功能以及神經系統的障礙。越來越多的證據顯示，腸道-腦的軸線存在著許多關聯，當腸道缺乏健康的菌株，可能使宿主的身心健康惡化。